Nemecz Labor Honlap

Kutatási áttekintés

A laboratórium a Kopernikusz Egyetemi Biokémiai Tanszékhez tartozik ami a lengyelországi Torunban található. A pentamer ligand-vezérelt ioncsatornák (pLGIC) működését és szabályozását magában foglaló molekuláris mechanizmusok tanulmányozására összpontosítunk. A pLGIC család, emlősökben, serkentő: nikotinos acetilkolin receptorokat (nAChR-ek), 3-as típusú szerotonin receptorokat (5-HT₃R-ek) és cink által aktivált ioncsatornákat; valamint gátló: A típusú γ-aminovajsav receptorokat (GABA_AR) és glicin receptorokat (GlyRs) tartalmaz. A pLGIC család a neuronok kémiai-elektromos jelátvitelét közvetíti. A felszabaduló szinaptikus neurotranszmitterek megkötése stabilizálja egy csatorna megnyitását, amely passzívan vezeti az ionokat a membránon keresztül, ami ezáltal sejtdepolarizációt vagy hiperpolarizációt vált ki. Mivel gyakorlatilag az összes neuronban mindenütt kifejeződnek, a pLGIC-k hozzájárulnak az összes fő központi idegrendszeri funkcióhoz; beleértve: szenzoros és motoros feldolgozás, központi autonóm vezérlés, memória és figyelem, alvás és ébrenlét, jutalom, fájdalom, szorongás, érzelmek és megismerés. A kábítószer függőség, különösen a dohányzás, és a neurológiai rendellenességek, mint például az Alzheimer-kór, a skizofrénia és a Parkinson-kór régóta kapcsolatban állnak a kolinerg rendszerrel, különösen a nAChR-ekkel. Sajnos a farmakológiai tanulmányok sok éven keresztül nem eredményeztek szilárd terápiát a nAChR-ek diszfunkciója által okozott bántalmakra, amelyek az egyéneket sújtják. Így a biokémiai technikák számos aspektusának alkalmazásával – a molekuláris biológiától, a fehérjebiokémiától, az elektrofiziológiától, az immunfluoreszcenciától és a farmakológiától kezdve – az a célunk, hogy információkat gyűjtsünk az intracelluláris doménről, és ezáltal ezen receptorok szabályozásáról/forgalmáról. Szabályozó fehérjéik megcélzása jobban leküzdheti a neurodegeneratív rendellenességeket, mint maguknak a receptoroknak a megcélzása.

Csapattagok

Mindig keresünk motivált személyeket, akik érdeklődnek a kutatásunk iránt. Ha úgy érzi, hogy megfelelő, vegye fel velünk a kapcsolatot.

adiunkt

Dr. Ákos Nemecz

adiunkt

dr Dorota Nemecz

Labor Kabalája/Őrzőkutya

Onyx

Posztdoktori Ösztöndíjasok

Doktoranduszok

Mester hallgatók

Biotechnológia

Weronika Nowak

Biotechnológia

Katarzyna Świstowska

Biotechnológia

Zuzanna Szutkowska

Bachelor hallgatók

Biotechnológia

Kamila Grygiel

Biotechnológia

Marcelina Mikołajczyk

Biotechnológia

Magda Tylenda

Biotechnológia

Kuba Wolinski

Volt Labortagok

Bachelor hallgatók

Agata
Wikarska

Bachelor hallgatók

Kacper
Roszak

Bachelor hallgatók

Jakub
Lewandowski

Projektek

A nikotinos acetilkolin receptorok szabályozási mechanizmusának vizsgálata
POLS-2020/37/K/NZ3/04098

A függőség elleni küzdelem az α3β4*-nikotinos acetilkolin receptorok megcélzásával
OPUS21-2021/41/B/NZ7/03101

Labor Hírek

• Tehetséges mesterszakos hallgatót keresünk aki szeretne doktori képzést folytatni egy fizetett doktori hallgató pozícióban:
  Doctoral Student w/ Stipend Announcement within NCN OPUS-21 Project
  Wydział Nauk Biologicznych i Weterynaryjnych/Faculty of Biological and Veterinary Sciences
  Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu/Nicolaus Copernicus University in Toruń
  
  Start Date: April 1st 2024
  Stipend Level: 5,000 PLN/month (gross/gross [brutto/brutto]: employer taxes, pension, health insurance and income taxes are deducted from this amount
  Stipend Duration: 48 months
  
  Project Description: Generation and characterization of synthetic single domain VHH antibodies against nicotinic acetylcholine receptor subtypes. Under the supervision of the project leader: Dr. Ákos Nemecz. More information about the lab and projects may be found at: nemeczlab.umk.pl
  
  Requirements:
  

  • Master of Science in biochemistry, pharmacology, biology, or related field, completed before beginning of doctoral dissertation.
    
  • Experience in a biochemical laboratory
  • Good communication skills.
  • Proficiency in written and spoken English.
  
  

  Please send the following application materials to Dr. Ákos Nemecz:
  

  • A cover/motivation letter
  • CV
  • A list of contact information (name, email, position/institution) for two references included in either the CV or cover letter
  • A signed GDPR statement: Found here
• Nyitott posztdoktori ösztöndíjas pozícióval rendelkezik:
  Post-Doctoral Position Announcement within NCN OPUS-21 Project
  Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu/Nicolaus Copernicus University in Toruń
  
  Start Date: As soon as possible
  Funding: 10,000 PLN/month (gross/gross: employer taxes, pension, health insurance and income taxes are deducted from this amount ≈7608 PLN/month [gross: personal income tax and social security deducted from this amount] with 13th month)
  Duration: 24month initial contract with possibility to extend an additional year.
  
  Candidatures will be evaluated on a rolling basis, until the position is filled.
  
  Project Description: Generation and characterization of synthetic single domain VHH antibodies against nicotinic acetylcholine receptor subtypes. Localization of these subtypes in the brain tissue samples. Under the supervision of the project leader: Dr. Ákos Nemecz. More information about the lab and projects may be found at: nemeczlab.umk.pl
  
  Requirements:
  

  • Ph.D. in biochemistry, pharmacology, biology, or related field.
    (PhD degree must be awarded by another institution than UMK w Toruniu or a continuous post-doctoral fellowship of at least 10 months has been completed, in another country than Poland, prior to hire);
    
  • Ability to work independently on a scientific project including: planning, completing, analyzing experiments as well as the ability to properly present the results;
  • Fluent in written and spoken English.
  
  

  Strongly preferred:
  

  • Experience in protein purification techniques and immunostaining
  • Good communication and team working skills
  
  

  Please send the following application materials to Dr. Ákos Nemecz:
  

  • A cover/motivation letter
  • CV, including list of publications/abstracts
  • A list of contact information (name, email, position/institution) for three references included in either the CV or cover letter
  • A signed GDPR statement: Found here
• 2023-02-20: dr Dorota Nemecz bemutatja absztraktját a Biophysical Society éves találkozóján San Diego-ban. Nézzen be hozzánk 13:45-kor, a BC kiállítási csarnokban Plakát#:LB75.
• 2022-10-27: Dr. Nemecz Ákos tanszéki szeminárium előadása 10óra-kor C226 előadóteremben
• A Nemecz Labor meg nyerte egyik helyezést a négyböl a 2022-es Emerging Fields versenyen a 'Cells as EXperimental platforms and bioFACTories (CExFact)' együttműködési csoport részeként, amelyet dr hab. Krzysztof Zienkiewicz irányit. Olvasson róla itt (lengyel nyelven)
• 2022-06-10: A POWER projekt “Universitas Copernicana Thoruniensis in Futuro – a Nicolaus Kopernikusz Egyetem modernizálása az Integrált Egyetemi Program részeként” részeként Dr. Pierre-Jean Corringer, a Pasteur Institutböl tart egy szemináriumot: “Illuminating the gating transition of pentameric channel-receptors”
  Üdvözöljük 2022-06-10, 11:00h a Darwin Teremben Szórólap

Publikációk

2024

• Van Renterghem C.^§, Nemecz Á., Medjebeur K., Corringer P-J.^§ “Short-chain mono-carboxylates as negative modulators of allosteric transitions in Gloeobacter violaceus ligand-gated ion channel, and impact of a pre-β5 strand (Loop Ω) double mutation on crotonate, not butyrate effect.” Physiol Rep (2024-02-11); 12(3):e15916. DOI: 10.14814/phy2.15916

2023

• Van Renterghem C.^§, Nemecz Á., Delarue-Cochin S., Joseph D., Corringer P-J.^§ “Fumarate as positive modulator of allosteric transitions in the pentameric ligand-gated ion channel GLIC: Requirement of an intact vestibular pocket.” J Physiol (2023-06); 601(12):2447-2472. DOI: 10.1113/JP283765. Epub 2023-04-27
• Li Q., Nemecz Á.^§, Aymé G.^§, Dejean de la Bâtie G., Prevost M.S., Pons S., Barilone N., Baachaoui R., Maskos U., Lafaye P., Corringer P-J.^§ “Generation of nanobodies acting as silent and positive allosteric modulators of the α7 nicotinic acetylcholine receptor.” Cell Mol Life Sci (2023-05-25); 80(6):164. DOI: 10.1007/s00018-023-04779-8

2022

• Nemecz D.^§, Golińska P. “Antibacterial Properties of Crotoxin from Crotalus durissus terrificus-Insight into the Mechanism of Action.” Molecules (2022-11-10); 27(22):7726. DOI: 10.3390/molecules27227726

2020

• Nemecz D.*, Ostrowski M.*, Ravatin M., Saul F., Faure G.^§ “Crystal Structure of Isoform CBd of the Basic Phospholipase A2 Subunit of Crotoxin: Description of the Structural Framework of CB for Interaction with Protein Targets.” Molecules (2020-11-13); 25(22):5290. DOI: 10.3390/molecules25225290

2018

• Hu H.*, Nemecz Á.*, Fourati Z., Van Renterghem C., Sauguet L., Corringer P-J., Delarue M.^§ “The active form of a new bacterial pentameric ligand-gated ion channel displays a widely open pore and is stabilized by an allosteric activator.” Proc Natl Acad Sci U S A (2018-04-24); 115(17):E3959-E3968. DOI: 10.1073/pnas.1717700115
• Bajek A., Olkowska J., Walentowicz-Sadłecka M., Sadłecki P., Grabiec M., Porowińska D., Drewa T., Roszkowski K.^§ “Human Adipose-Derived and Amniotic Fluid-Derived Stem Cells: A Preliminary In Vitro Study Comparing Myogenic Differentiation Capability.” Med Sci Monit. (2018-03-24); 24:1733-1741. DOI: 10.12659/msm.905826

2017

• Nemecz Á., Hu H., Fourati Z., Van Renterghem C., Delarue M., Corringer P-J.^§ “Full mutational mapping of titratable residues helps to identify proton-sensors involved in the control of channel gating in the Gloeobacter violaceus pentameric ligand-gated ion channel.” PLoS Biol (2017-12-27); 15(12):e2004470. DOI: 10.1371/journal.pbio.2004470
• Maj M.*^§, Bajek A.*, Nalejska E., Porowińska D., Kloskowski T., Gackowska L., Drewa T. “Influence of Mesenchymal Stem Cells Conditioned Media on Proliferation of Urinary Tract Cancer Cell Lines and Their Sensitivity to Ciprofloxacin.” J Cell Biochem. (2017-06); 118(6):1361-1368. DOI: 10.1002/jcb.25794. Epub 2016-11-30.
• Wujak M., Hetmann A., Porowińska D., Roszek K.^§ “Gene Expression and Activity Profiling Reveal a Significant Contribution of Exo-Phosphotransferases to the Extracellular Nucleotides Metabolism in HUVEC Endothelial Cells.” J Cell Biochem. (2017-06); 118(6):1341-1348. DOI: 10.1002/jcb.25791. Epub 2017-01-03.
• Czarnecka J., Porowińska D., Bajek A., Hołysz M., Roszek K.^§ “Neurogenic Differentiation of Mesenchymal Stem Cells Induces Alterations in Extracellular Nucleotides Metabolism.” J Cell Biochem. (2017-03); 118(3):478-486. DOI: 10.1002/jcb.25664. Epub 2016-08-25.
• Bajek A.^§, Olkowska J., Walentowicz-Sadłecka M., Walentowicz P., Sadłecki P., Grabiec M., Bodnar M., Marszałek A., Dębski R., Porowińska D., Czarnecka J., Kaźmierski Ł., Drewa T. “High Quality Independent From a Donor: Human Amniotic Fluid Derived Stem Cells-A Practical Analysis Based on 165 Clinical Cases.” J Cell Biochem. (2017-01); 118(1):116-126. DOI: 10.1002/jcb.25618. Epub 2016-06-28.
• Roszek K.^§, Makowska N., Czarnecka J., Porowińska D., Dąbrowski M., Danielewska J., Nowak W. “Canine Adipose-Derived Stem Cells: Purinergic Characterization and Neurogenic Potential for Therapeutic Applications.” J Cell Biochem. (2017-01); 118(1):58-65. DOI: 10.1002/jcb.25610. Epub 2016-06-03.

2016

• Ostrowski M.^§, Mierek-Adamska A., Porowińska D., Goc A., Jakubowska A. “Cloning and biochemical characterization of indole-3-acetic acid-amino acid synthetase PsGH3 from pea.” Plant Physiol Biochem. (2016-10); 107:9-20. DOI: 10.1016/j.plaphy.2016.05.031. Epub 2016-05-20.
• Ostrowski M., Porowińska D., Prochnicki T., Prevost M., Raynal B., Baron B., Sauguet L., Corringer P-J., Faure G.^§ “Neurotoxic phospholipase A2 from rattlesnake as a new ligand and new regulator of prokaryotic receptor GLIC (proton-gated ion channel from G. violaceus).” Toxicon (2016-06-15); 116:63-71. DOI: 10.1016/j.toxicon.2016.02.002. Epub 2016-02-05.
• Nemecz Á.*, Prevost, M.S.*, Menny A.*, Corringer P-J.^§ “Emerging Molecular Mechanisms of Signal Transduction in Pentameric Ligand-Gated Ion Channels.” Neuron (2016-05-04); 90(3):452-70. Review. DOI: 10.1016/j.neuron.2016.03.032

2015

• Roszek K.^§, Porowińska D., Bajek A., Hołysz M., Czarnecka J. “Chondrogenic Differentiation of Human Mesenchymal Stem Cells Results in Substantial Changes of Ecto-Nucleotides Metabolism.” J Cell Biochem. (2015-12); 116(12):2915-23. DOI: 10.1002/jcb.25239
• Bajek A.*^§, Porowińska D.*, Kloskowski T., Brzoska E., Ciemerych MA., Drewa T. “Cell therapy in Duchenne muscular dystrophy treatment: clinical trials overview.” Crit Rev Eukaryot Gene Expr. (2015); 25(1):1-11. DOI: 10.1615/critreveukaryotgeneexpr.2015011074

2014

• Stadnicka K., Marszałek A., Kozłowska I., Walasik K., Bodnar M., Bajek A., Porowińska D., Drewa T., Bednarczyk M. “The expression of p63 and Ck HMW in magnum and infundibulum of Gallus domesticus oviduct.” Folia Biol (Krakow) (2014); 62(3):179-85. DOI: 10.3409/fb62_3.179
• Sauguet L.*, Shahsavar A.*, Poitevin F.*, Huon C., Menny A., Nemecz Á., Haouz A., Changeux J-P, Corringer P-J, Delarue M.^§ “Crystal structures of a pentameric ligand-gated ion channel provide a mechanism for activation.” Proc Natl Acad Sci U S A (2014-01-21); 111(3):966-71. DOI: 10.1073/pnas.1314997111

2013

• Uzarska M.^§, Porowińska D., Bajek A., Drewa T. “[Epidermal stem cells--biology and potential applications in regenerative medicine].” Postepy Biochem. (2013); 59(2):219-27.
• Wujak M., Banach M., Porowińska D., Piskulak K., Komoszyński M.^§ “Isolation and bioinformatic analysis of seven genes encoding potato apyrase. Bacterial overexpresssion, refolding and initial kinetic studies on some recombinant potato apyrases.” Phytochemistry (2013-09); 93:8-17. DOI: 10.1016/j.phytochem.2013.03.014. Epub 2013-05-09.
• Porowińska D.^§, Wujak M., Roszek K., Komoszyński M. “[Prokaryotic expression systems].” Postepy Hig Med Dosw (Online) (2013-03-01); 67:119-29. DOI: 10.5604/17322693.1038351

2012

• Yamauchi J.G., Gomez K., Grimster N.P., Dufoil M., Nemecz Á., Fotsing J.R, Ho K-Y., Talley T.T., Sharpless K.B., Fokin V.V, Taylor P.^§ “Synthesizing selective agonists for the α7 nicotinic receptor with in situ click-chemistry on acetylcholine binding protein templates.” Mol. Pharmacol. (2012-10); 82(4):687-99. DOI: 10.1124/mol.112.080291
• Rojsanga P., Boonyarat C., Utsintong M., Nemecz Á., Yamauchi J.G., Talley T.T., Olson A.J., Matsumoto K., Vajragupta O.^§ “The effect of crebanine on memory and cognition impairment via the alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor.” Life Sci. (2012-08-21); 91(3-4):107-14. DOI: 10.1016/j.lfs.2012.06.017
• Porowińska D., Marszałek E., Wardęcka P., Komoszyński M.^§ “[In vitro renaturation of proteins from inclusion bodies].” Postepy Hig Med Dosw (Online) (2012-06-11); 66:322-9. DOI: 10.5604/17322693.999918
• Grimster N.P., Stump B., Fotsing J.R., Weide T., Talley T.T., Yamauchi J.G., Nemecz Á., Kim C., Ho K-Y., Sharpless K.B., Taylor P., Fokin, V.V.^§ “Generation of candidate ligands for nicotinic acetylcholine receptors via in situ click chemistry with a soluble acetylcholine binding protein template.” J Am Chem Soc (2012-04-18); 134(15):6732-40. DOI: 10.1021/ja3001858

2011

• Nemecz Á., Taylor P.^§ “Creating an α7 nicotinic acetylcholine recognition domain from the acetylcholine binding protein: crystallographic and ligand selectivity analysis.” J Biol Chem (2011-12-09); 286(49):42555-65. DOI: 10.1074/jbc.M111.286583
• Yamauchi J.G., Nemecz Á., Nguyen Q.T., Muller A., Schroeder L.F., Talley T.T., Lindstrom J., Kleinfeld D., Taylor P.^§ “Characterizing ligand-gated ion channel receptors with genetically encoded Ca2++ sensors.” PLoS One (2011); 6(1):e16519. DOI: 10.1371/journal.pone.0016519
• Porowińska D., Czarnecka J., Komoszyński M.^§ “[The role of ectonucleotides metabolizing enzymes in purinergic signaling].” Postepy Biochem. (2011); 57(3):294-303.

Finanszírozás